SSAR是标准的安全分析报告。
简单重复序列(SSR)标准
一、基本概念与特征
1、定义:简单重复序列(Simple Sequence Repeats,简称SSR),也被称为微卫星DNA(Microsatellite DNA),是由几个核苷酸(一般为16个)为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联重复序列,每个SSR两侧的序列一般是相对保守的单拷贝序列。
2、分类:根据重复序列的重复单位的长度,可将串联重复序列分为卫星DNA、微卫星DNA、小卫星DNA等,微卫星DNA即简单重复序列,是基因组中由1~6个核苷酸组成的基本单位重复多次构成的一段DNA。
3、特点:SSR标记具有数量丰富、覆盖整个基因组、揭示的多态性高、具有多等位基因的特性、以孟德尔方式遗传、呈共显性等特点。
二、技术原理与应用
1、技术原理:由于基因组中某一特定的微卫星的侧翼序列通常都是保守性较强的单一序列,因而可以将微卫星侧翼的DNA片段克隆、测序,然后根据微卫星的侧翼序列就可以人工合成引物进行PCR扩增,从而将单个微卫星位点扩增出来,由于单个微卫星位点重复单元在数量上的变异,个体的扩增产物在长度上的变化就产生长度的多态性,这一多态性称为简单序列重复长度多态性(SSLP)。
2、应用领域:SSR标记已广泛用于遗传图谱的构建、目标基因的标定、指纹图的绘制等研究中,在游戏领域,SSR也是卡牌稀有度的一种表示方式,特指superior super rare,即较高级的超级稀有卡牌。
三、表格对比不同分子标记技术
分子标记技术 | 技术特点 | 优点 | 缺点 |
SSR(简单重复序列) | 以特异引物PCR为基础的分子标记技术 | 数量丰富、多态性高、共显性 | 开发费用高、需要克隆测序 |
AFLP(扩增片段长度多态性) | 通过PCR扩增基因组DNA限制性片段 | 多态性强、不需序列信息 | 实验流程复杂、成本高 |
RAPD(随机扩增多态性DNA) | 利用随机引物扩增基因组DNA | 操作简便、成本低 | 稳定性较差、重复性差 |
SNP(单核苷酸多态性) | 基于单个核苷酸的变异 | 密度高、稳定性好 | 检测成本高、技术要求高 |
四、FAQs
Q1: SSR标记与其他分子标记技术相比有哪些优势?
A1: SSR标记的优势主要包括数量丰富、覆盖整个基因组、揭示的多态性高、具有多等位基因的特性、以孟德尔方式遗传、呈共显性等特点,这些特点使得SSR标记在遗传学研究和基因组分析中得到广泛应用。
Q2: 在游戏中,SSR卡牌的稀有度如何?
A2: 在游戏中,SSR代表的是superior super rare,即较高级的超级稀有卡牌,这类卡牌通常具有较高的稀有度,获取几率相对较低,如一般游戏中SSR卡牌的获取几率约为1%左右。